水窗是指軟X射線的波長範圍處在2.34nm與4.4nm之間,前者對應氧原子的K吸收帶,後者對應碳原子的K吸收帶,即X射線光子能量範圍在530eV到280eV間.在此範圍內,水不吸收X射線,即水對X射線是透明的.但是,此範圍內的X射線會被氮原子和其他構成生物機體的元素吸收,因此,該波長可用於對活體生物樣本進行X射線顯微。