用膠囊裝的藥物，一般都是對食道和胃粘膜有刺激性的粉末或顆粒，或口感不好、易於揮發、在口腔中易被唾液分解，以及易吸入氣管的藥。這些藥裝入膠囊，既保護了藥物藥性不被破壞，也保護了消化器官和呼吸道。去掉膠囊殼可能會造成藥物流失、藥物浪費、藥效降低。另外，有些藥物需要在腸內溶解吸收，膠囊保護藥物不被胃酸破壞。 醫藥上指用特種成膜材料（如明膠、纖維素、多糖等）製成的囊狀物，把內容物（如粉狀、液體狀各類藥物等）或按劑量裝入其中，便於吞服。2012年4月，某些企業用皮革廢料造藥用膠囊被公安部門查處。