民族問題產生的自然因素主要是指各個民族之間由於民族結構(經濟結構、文化結構、體制結構等)的不同而存在著巨大的個體的差異,進而導致民族問題的產生。還有另外一種情況,即民族間由於自然的差異特別是由於生活方式不同而造成的摩擦和衝突。
從自然屬性考察,民族是一個客觀的社會存在,構成社會機體的獨特細胞。每個民族都是具有自己獨特屬性和獨立結構的事物,當不同個體並列在一起時,即顯現出差異。
不同民族的生活方式需要協調,長期形成的生活方式具有極大的穩定性,並寄託著民族的某種精神或感情。但輕易改變生活方式會引起抵制和矛盾,從而產生民族問題。